Из-за сложного материального положения в семье, Бабакин начал трудиться, окончив всего 7 классов. Аттестат об образовании он все же получил в 1937 году, сдав экстерном экзамены за десятилетку.
После чего поступил на заочное отделение института связи (после войны – Всесоюзный заочный электротехнический институт связи). Но учебу пришлось прервать по причине большой загруженности работой и начавшейся войны.
Он окончил институт лишь в 1957 году, то есть 20 лет спустя. К тому времени, работая в 1943-1949 годах в Институте автоматики, Бабакин дорос уже до главного конструктора, занимался радиолокационными системами.
Потом С.П. Королев пригласил его к себе в НИИ-88, где Бабакин работал над системами наведения.
С 1952 года он был переведен в ОКБ им Лавочкина, где занимался разработкой первой советской зенитной ракеты для ПВО Москвы (С-25, «Беркут»).
С 1965 года в качестве главного конструктора НПО им. Лавочкина Георгий Николаевич выполнял работы по беспилотным лунным и планетным зондам. Он доработал аппараты (типа «Луна» и «Венера»), которые конструировались в КБ Королева.
Уже 3 февраля 1966 года произошло выдающееся в истории космонавтики событие – аппарат «Луна-9» совершил первую мягкую посадку на другое небесное тело. Земля приняла несколько телевизионных панорам поверхности Луны.
Потом был первый в мире «Луноход-1», первый зонд к Венере и др.
В 66-м году Бабакин стал лауреатом Ленинской премии, в 68-м доктором технических наук, в 70-м - членом-корреспондентом Академии наук и Героем Социалистического Труда.